По договору генподряда реконструкция здания начинается в апреле 2011 г., заканчивается в сентябре 2012 г.

По договору генподряда реконструкция здания начинается в апреле 2011 г., заканчивается в сентябре 2012 г.
По договору Генподрядчик обязуется по окончании каждого месяца предъявлять Застройщику акт выполненных работ (Форма № КС-2), справку о стоимости выполненных работ и затрат (Форма № КС-3), акт сдачи-приемки выполненных работ, услуг генподряда, акт сдачи-приемки выполненных работ за выполнение функций строительного контроля, счета-фактуры.
После завершения реконструкции объекта Генподрядчик предъявляет Застройщику акт приемки законченного строительством объекта (Форма № 11) и счет-фактуру, акты формы № КС-2 с комплектом исполнительной документации по завершенным работам, формы № КС-3. Кем подписывается акт по форме КС-11?

Согласно утвержденной Постановлением Госкомстата России от 30.10.1997 № 71а типовой межотраслевой форме № КС-11 акта приёмки законченного строительством объекта данный документ подписывают с одной стороны исполнитель работ (в данном случае генеральный подрядчик), а с другой заказчик (в данном случае Застройщик).

Генеральный подрядчик и Застройщик являются юридическими лицами. 
В соответствии со ст. 27 НК РФ законными представителями налогоплательщика-организации признаются лица, уполномоченные представлять указанную организацию на основании закона или её учредительных документов.

В Федеральном законе от 08.02.1998 № 14-ФЗ «Об обществах с ограниченной ответственностью» и в Федеральном законе от 26.12.1995 № 208-ФЗ «Об акционерных обществах» указывается, что единоличный исполнительный орган общества без доверенности действует от имени общества, в том числе представляет его интересы и совершает сделки.
Также представитель юридического лица может быть уполномочен на подписание данного акта доверенностью в соответствии со ст. 182, 185 ГК РФ.

Доверенностью признаётся письменное уполномочие, выдаваемое одним лицом другому лицу для представительства перед третьими лицами. Доверенность от имени юридического лица выдаётся за подписью его руководителя или иного лица, уполномоченного на это его учредительными документами, с приложением печати этой организации.

Таким образом, акт от имени юридических лиц (генерального подрядчика и застройщика) может подписать законный представитель организации (исполнительный орган, например, генеральный директор) либо уполномоченный представитель организации по доверенности.